Hola @cplaza8908,
Te recomiendo veas este post en el foro el cual contine una liga a un componente con un ejemplo que utiliza el nodo Wait para esperar ha que haya un archivo. Need node to watch directory to start automated process! Please Help! - #5 by gab1one
La otra opción es con el Servidor de KNIME, el cual puede ayudarte a agendar los flujos y correrlos cada minuto u hora, etc. Si el archivo existe en la carpeta, entonces puede continuar el flujo o terminar.
Saludos,
Cynthia